>MED4genome 979 bp rna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAU------- ---------- ---------- ---UUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUA-CAU A--UU-UAAA GA--GGGAAA U--------- --UGUUUU-G AGUCGUGUCC UAAUUU-GCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUA------ ---------- -----UUCAA ---------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUUU---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAG- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUUGAACGAC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MED4 892 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAU------- ---------- ---------- ---UUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..A-----UA UCUCUAUGU. ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .-------CU GAAUACCA-C CUCUUA-CAU A--UU-UAAA GA--GGGAAA U--------- --UGUUUU-G AGUCGUGUCC UAAUUU-GCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUA------ ---------- -----UUCAA ---------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUUU---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAG- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUUGAACGAC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9515 1009 bp rna .......... .......... .......... ..CUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UU----- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUA-CAU AUAAA-UAAA GA--GGGAAA U--------- --UGUUUU-G AGUCGUGUCC UAUA---GCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUCU------ ---------- -----UU-AA U--------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUUA---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUCAAAUAG- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUUGAACGAC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >RS810 1027 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CG-GGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCACUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-C-U AA-UC-AAUA GA-AAGGGAA ---------- --UCUUAU-G UGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC A-UAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUU U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UUUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MB11E08.2 567 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......A--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAU------- ---------- ---------- ---UU----- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- UUUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUA-CAU A--UU-GUAA AA-GGGGAGA AU-------- --UAUUUU-G AGUCGUGUCC UAAUUU-GCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUA------ ---------- -----UUCAA ---------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UCUUA----- ---------- --UUCAUUGU UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU A-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MB11F02.2 568 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......A--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUUUUA-CAU A--UU-GUUU AA-GUGGGAA AU-------- --UGUUUU-G AGUCGUGCCC U--UUUUGCU CUGAGU---- ----GAAUUU AGCUUCCUAA UUUA------ ---------- -----UUUGA U--------- ---------- --------AA AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUUA---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAA--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >AS9601 1004 bp rna .......... .......... .......... AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------U-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UAUA GA-AAGGAAA ---------- --AAUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------CC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------UG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >GP2 1033 bp rna ---CGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG GGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUAU-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAAUU-UAUU GA-AGGGAAA ---------- --U-UUUU-- AGGUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- -------CUU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9107 1037 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUAUUU AUU------- ---------- ---------- AUUGAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-- AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- -------UUU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9116 995 bp rna ---------- ---------- ---------- ---------- -----UAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUAUUU AUU------- ---------- ---------- AUUGAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-- AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- -------UUU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9123 1037 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUAUUU AUU------- ---------- ---------- AUUGAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-- AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- -------UUU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9201 1032 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUCC-U CAA------- ---------- ---------- ---UAUUA-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUU---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-AGUA AG-AAGGAAA ---------- -AAUUUCU-G AGUUGUGACC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9202 1030 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAACU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUGC-CAU A-UUU-UGUA AA-AGGGAAA ---------- --UAUUAU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9215 1015 bp rna ---------- --------CA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAACU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- --C--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGCU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUGC-CAU A-UUU-UGUA AA-AGGGAAA ---------- --UAUUAU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9301 991 bp rna ---------- ---------- ---------- ---------- -----UAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAA-UU---- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9302 1035 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---AUUAAU- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AAUUU-UAUA GA-AGGGAAU ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- -------CUU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-U-AAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9311 1031 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA NACUCGCAAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U CGA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAA- ---------- --UGUUUUGG AGUUGUGAUC AAAU------ CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9312 1031 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCAAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U CGA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAA- ---------- --UGUUUUGG AGUUGUGAUC AAA--U---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >MarG04_H0 641 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........C U-AUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GUAAAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH06_H0 631 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........G GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUCC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UAUUUU-G AGCUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUGCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE08_0 637 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...UGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAGG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG07_H0 623 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......GUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE09_0 637 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUUU-CU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GUAAAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGU------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC GUUAAGAUGC UGGAUUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG10_H0 633 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAAAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------U-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF03_0 636 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--U-UUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGAAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG03_H0 633 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......CUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGUCA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUU---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAAUU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGACC AAAUC----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UAA------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH03_0 663 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGUUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUC-CAU AU-UU-UAAA GA--UGGAGA U--------- --UGUAAU-G AGUCGUGUUC UAAUUUUGCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUUA----- ---------- -----UUUAA ---------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUUA---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCGUAG AU--U-UUUU --GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UAUA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGA....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC04_100 635 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....ACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG GGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC ACUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH02_H0 599 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-UCU AAGUCC-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GUAAAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC03_100 645 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......GGC U-AUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- ------AAUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAC--- ---------- ---------- ---------- UUUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-AU-UUAA AG-AAGGGAA U--------- --AGUUAU-G AGCGUUGAUU UACUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UA-A------ ---------- --------AU ---------- ---------- --------AC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -UAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UGAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUAU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG12_H0 636 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAUUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------CC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAAU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAACUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG09_HO 640 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... CUAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-GGUA AA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCCUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAC----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG01_H0 638 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AAAGGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUC UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAAU-G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU AUCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH07_H0 640 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAAUC-UGU- GAGAAGGAAA AA-------- --UUUUUU-G UGUUGUGACC AUAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC UUUUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF07_0 621 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUCC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UC UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUAU-UUAU U--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUAGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE01_0 632 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GA GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA----UUAU U--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUAGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF08_0 637 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGWUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUCU-UUUA GAUAAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUGAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- AAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG08_H0 629 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........G GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UCA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UGUA GA-AAGGAAA A--------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UUUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH08_H0 628 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUU--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUUU-UUAU U--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUAGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AC ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUAU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACGAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF01_0 638 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... CUAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCG-C CUCUUC-CAU AA-UU-UGUA GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AC--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF09_0 635 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUCU-UUAG A--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUGAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE10_0 632 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA----UUAU U--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUAGUGAUC AAAUU----- CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUACAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF10_0 632 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA----UUAU U--AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUAGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUGUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE11_0 635 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...UGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UGUA GA-AAGGAAA A--------- --UUUUU--G AGUUGUGAUC AUAAAU---- CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- ---------C AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUCG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF11_0 637 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AAAGGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AACGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGWGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUGG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUU AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UUUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG11_H0 630 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AAAGGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -U---CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-GUA- GAAAGGGAA- ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCUUAA UAA------- ---------- --------UC U--------- ---------- --------UU AUUAGGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UGAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCGA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UCG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE12_0 627 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAAUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUCA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUCU-GUA- GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AACUU----- CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF12_0 633 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......CUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UUUA GA-AAGGAAA A--------- --UUUUU--G UGUUGUGAUC UUAAAU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------CC AUUAAGAWGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH04_H0 638 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GGGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAUCC-GUAG AA-AGGGAA- ---------- --UUUUUU-G AGUCGUGACC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE05_0 636 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUU AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAA AU--UUUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG05_H0 623 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........CG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUCC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUACGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UUUA UU-AAGGAAA AU-------- --UAUU---G AGUCGUGAUC AAAU------ CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarH05_H0 627 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGWAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAAGU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACAA-C CUCUUG-CAU AA-UC-UAU- -----GGAAA ---------- --UGUUUU-G AGAUGUGAUC AAAUC----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UAA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAU -UAAG-CAUC U-UU-AU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAA----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE06_0 636 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....GACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGCUGUGAUC AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UUUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarA11_125 795 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-UAA -ACU-GAUU- AUGAUGUCUG AU-------- -U--UAU-AA A--------- -------UUU AGGCCGUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUA-U UAG-CUGUG- AAAUUGA--- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UCACU UAUCAUC-AG UCUUUUAAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-UCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUGC CUGAUAACUC CAAUU--GGA GA-UUGUUAU ---------- -UUGUUAAAU GUGAUUU-AG AUGUUGUUCA ACUGAAU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CACUCC-UGA AUUAA----- -------U-- UUU------- ---------- ----AGG-CU GAUAAGACGC UGGGCUC--A CUGAAUGUUC ---------- UAAG------ ------GGAU AUUCAGUUU- GUUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAA-UCU A-GAAA-AAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CAUAGA AGUU---UUU CAUUUUU--A ---------- -AUGA----- ---------- ---------- ---UUAGACU UUCUAUG--U UUAA-UUCUU --GAGUU-AG AGC-AAAU-- UUUCUAUUAC UUAAUUCACU -UA--GGGAU A--------- ---------- ---------- ---------- ---AGUGAAU UACUAACUAA UUAA-UUUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AGC UAAGUUUAAU AGAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGA....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC11_100 802 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......CUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA--UA AACU-GAUU- AUGAUGUCUG AU-------- -U--UAU-AA A--------- -------UUU AGGCCGUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUA-U UAU-CAGUG- AAAUUGA--- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UCACU UUUUACU-GG AUUUUUAAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGCCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUGC CUGAUAACUC AAUUUU-GGA GA-UUGUCAU ---------- -UUGUUUAAU GUGAUUU-AG AUGUUGUUCA ACUGAAG--- ----GAACCU AGCUUCCUGU CAUUCC-UGA AUUAA----- -------UU- UUU------- ---------- ----AGG-CU GAUAAGACGC UGGGCUC--A CUGAAUGUUU ---------- CAAG------ ------GAAU AUUCAGUUU- GUUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AA-GUCU G-GAAA-AAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CAUAGA GGUUUGUUUU CAUUUU---A ---------- -AUGA----- ---------- ---------- ---UUAGACU U-CUAUG--U UCAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AAAU-- UUUCUAUUAC UUAAUUCGCU -UA--UA--U U--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------U U--------- ---------- ---------- ---------- --AAGUGAUU UGCUAAUUGA UGUUAGCUGA AGUUAAUAGA UUUAUUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGA....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarB02_125 809 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........C UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACAAACA -AUU-GAUCU UGAUG-UCUA AG-------- -UAUUUAAAU U--------- -------CUU AGGCCUAGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUCAU UUU-UAAUUC GGAG------ ---------- ---UUUA--- ---------- -----UAAUU CCAGAAA-UA --CAUGAAUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCCACU-C CUGAUAGCGA AAACCAAAUU GG-AGAUAUC AA-------- --UGUUUCUU GUGACUU-AG AAGUUAUUUC UCUGAAAU-- ----GAACCU AGCUUCCUUU CAUUCC-ACA AAAAGCUAAA AUUAAAAUAG UUUU------ ---------- ----AGG-UU GUAAGGAUGC UGGGCUC--A CUGAAA---- ---------- UUCA------ ----ACGAAU UUUUAGUAA- G-UUCAGUA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAAAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUUAU UUCUUUUAUU UAUA-UUAGG AAUUCAUCGC CUCUGUGUGC CUUAAAUAAA AUUUCCUAAG UUUAAGUAAA AAGAAAUUGU GUUUAAUUCU U-GAGUUAAG AGCCA----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG ACUCUAAAAA UAUUAAUUUA GAGUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarA04_125 871 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........GC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA -ACU-GAU-C UUGAUGUCUG AG-------- -UA-UUUAAU U--------- -------CUU AGGCCAAGGU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAUUAAU AG--CUUAG- -UUG-UGA-- ---------- ---AUAU--- ---------- -----UCA-- -UUAGGC-GA GCUUAUGAUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GGUUGACUUU CU-------- ---UCAACGC CA--AAAAGU UGAGGAGCAU UGUGUGA--U GUGACUU-GG A-UUGUUCCC -GCUGAUG-- ----GAACCU AGCUUCCUUU CAUUCC-AUG AAUAAAUCA- ------UUAA UU-------- ----GAUUUA AUUCAGG-UU GAAAAGAUGC UGGGCUC--A CUUUGAUUU- ---------- UUAA------ --------AA UCUUAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAGAA AAAAG-CAUC U--C-AU-GG AUAAACUGUU CUUUUUCAAA UUAAGUAAUA ---------- ---------- --GUAAUUUC UAUUGCCUAA UUAAGAUGAG AAUAGUA--U UUAAAUUCUU --GAGUUA-G AGCCGAGAG- CUUAU-AGCG U-CUUUUCU- -GCUCUUAUG GCAUGAAAAG UUAGAUUGA- -AUUAUUCCU UUUAUCUUAA AA-GACAAUA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AUCAAGAA UGCG-UUUCA ACAACGUUUA CCGCUAUAA- GAAUUUAU-- -GGUCAAGCU ACGAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarA01_125 862 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........GG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCYGGAUYAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA -ACU-GAU-C UUGAUGUCUG AG-------- -UA-UUUAAU U--------- -------CUU AGGCCAAGGU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAUUAAU AG--CUUAGC -UUG-UGA-- ---------- ---AUAU--- ---------- -----UCA-- -UUAGGC-GA GCUUAUGAUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GGUUGACUUU CU-------- ---UCAACGC CA--AAAAGU UGAGGAGCAU UGUGUGA--U GUGACUU-GG A-UUGUUCCC -GCUGAUG-- ----GAACCU AGCUUCCUUU CAUUCC-AUG AAUAAAUCA- ------UUAA UU-------- ----GAUUUA AUUCAGG-UU GAAAAGAUGC UGGGCUC--A CUUUGAUUU- ---------- UUAA------ --------AA UCUUAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAGAA AAAAG-CAUC U--C-AU-GG AUAAACUGUU CUUUUUCAAA UUAAGUAAUA GUAAUUUCUA UUGCC----- ---------- -------UAA UUAAGAUGAG AAUAGUA--U UUAAAUUCUU --GAGUUA-G AGCCGAGAG- CUUAU-AGCG U-CUUUUC-U GCUC-UUAUG GCAUGAAAAG UUAGAUUGAA UUAUUCCUUU UAUCUUAAAA GACAAUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AUCAAGAA UGCG-UUUCA ACAACGUUUA CCGCUAUAA- GAAUUUAU-- -GGUCAAGCU ACGAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF06_0 624 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......GUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-GGUA AA-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUU U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC07_100 766 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......GUCG UAACGAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -ACU-GAU-C UUGAUGUUUA AG-------- -UA-AUUAAU C--------- -------CUU AGACCAUGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAACUA-G UU--CAAAAA AUUCUGA--- ---------- ---AAUA--- ---------- -----UCAGA UCUUUUU-UA UAACUGGUCU -CAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCC-ACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG-U-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCGACCUC CUGACGGAGA AAUCCAAGGA GA-CAUUU-- ---------- -UUGUUUAAU GUGAUUU-AG ACGUUGUUUU AUCUGAAU-- ----GAACCU AGCUUCUUGU CAUUCC-AAA CCU------- --------AA CUUUU----- ---------A GAACAGG-UU GACAUGACGC UGGGCUC--A ACACAA-UU- ---------- AAUUU----- -------AAA UUGUGGAGAU G-UUCAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUUUU UUUCUGUAUG UUAAUUAUUU GCAUUAAAUU AUAAU----- ---------G UUAAUAAUUU UUAAACAGAG AAUAAUGUUU UCAU-UUCUU --GAGUAA-A AACCAAGA-- CUCUAUUUUG UU-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AAUAUAGA GA-UAAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC09_100 801 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........G CUAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA AACU-GAUU- GUGAUGUCUA GG-------- -UUAUUUAUU C--------- -------CU- AGGCCACGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGGUUAGG AAU-GAAUUA GCUAUUGA-- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UCAGU UUCUAG--UU UUUAUUAAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGU--- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GAUGUU U--------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAU----GGA GA-------- ---------U UGU-CAU-UU GUUUGCAGUG ACUUAGAUGU UGUUCUUUU- ----GAAUGA ACCUAGCUUC CUAUCA-CUC UUUAUUUAU- ----UUCUAA U--------- ---------- ---GAGA-CU GAUAAGACGC UGGGCUC--A CUGAUA---- ---------- GAAG------ ---------- UAUCAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AA--AAGUCU G-GAAAAA-- -AAAG-CAUC U--AAAU-AG AUU-UAUGGA AGCUUUUAA- ---------- ---------- --U------- ---------- ---------- --UUAAAAGU UUCUAUA--U UCAA-UUCUU --GAGUU-AG AGCAAAAG-- UUCUAUGACU GCAUUCACUU AAAUUUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUAA ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUGGAG UUCUAAUUUU UAUUAGACAG UUAUAUAGCA AUUUUAAU-- -GGUCAAGCU ACGAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGA....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarC10_100 848 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......GGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A AACU-GAUUC AUGAUGUUUG GG-------- -UA-AUUUAU U--------- -------CUC AAACCAUGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAUUUGAU UAU-UUAUCU UUAAGGCU-- ---------- ---AAAA--- ---------- -----GCUUU UGGUAGA-AA AUAAUUAACU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG-U-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUUUU ---------- -----GGGGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCGAAACU CUUGAU---- -------GGC GA-GAUCAAA GGAGCUUCCU UUGUUAA-UU GUGAUUU-AG A-UUAAAAUU CAAUUGAAU- ----GAACCU AGCUUCCUUU CAUUCC-UUA UACAUAAU-- ------UAAU ---------- --AGAAUCUU GUUUAGG-UU GAAAAGAUGC UGGGCUC--U CUGAA----- ---------- AUCA------ ---CUAAUGA UUUCAGAUAA G-UUCAGUA- GAACCUUGAA AACUGCAUA- GU--GAGUCU G-GAAAAAUA -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-UACUAA UUCCAGUGUC UAAGUUU--- ---------- -GAAA--UUC UGUUUUCCAG UAUUCAAACU UUGAUAUCUU UAAUUAG--U UUAA-UUCUU --UAGU-AAG AGCCGAGU-- CUCUAUAGGC UUUAAUCUAU UUAGAUACCU ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AUUAA ---------- ---------- ---------- ---------- ----UUUAGU UGUGUAUAAA UGAUUAGGAG CUGCUAUAGA GAUUAUUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarA06_125 922 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........GC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UGUUUUAAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAGUUGAG AAU-CAAAGA AAAGCUGA-- ---------- ---GUAA--- ---------- -----UCAGC UUGGAGAUUG AUGAUUGAUU UUAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG AAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GACGAAUCUU CUG------- ---ACAACGA GC-CAAUGGU GAGAA-UCGU UGUGUGA--U GUGAUUU-AG AAUUUAAGUU UGCUGGC-A- ----GACCCU AGCUUCUUAU CAUUCC-AGG ACUCAA---- ------UCAA ---------- ------UUGA GAUGAGG-UU GAUAGGACGC UGGGCUC-AA CUGUAAUUC- ---------- GCAA------ -------GAA UUGCAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUGAU UCUUGGGAAU CAGCUGAUGC AAUCUGC--- -GCGA----- ----GCAGAG AGCUGAGGUU GAUGAACUAG AAUGAUG--U UUGA-UUCUU --GAGUCAAG AGCCGAGA-- CUCUAUAGCG UUCUUUCGAU -GUCAUCGAG GCAUCGAGAG UUUGAUUGGU GAUUCAAACC AUUUUCAAUG ACAAACAAUU CAG------- -----UUUAA ---------C UGGAGAAGUU UGAGAUUGAA GCCAGGUGAA UUGCUAAGAA UACGUAUUCA ACUACGUGAA GCGUUAUAGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUG...... .......... .......... .......... 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---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCG AUUGUGAAGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA CG-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAGA------ --UUGAUCAU UGGAUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAAA-C -AAAG-CAUC U--U-AC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGGUGACUAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCACGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarE03_0 852 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....ACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UAAUUU-AU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGG--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCU UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAA AGCCA-CUCG GUUGUGAUGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA GG-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAGG------ --UUGAUCAU UGGAUUUGCA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGCGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGAUUAUUAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUC.... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarF04_0 890 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...UGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UAGUUU-AU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUCAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG GUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCU AUUGUGAUGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCAGGGUAAA GG-------- UUU------U UACUCGAAUA AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUCGAA UUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ -UUGGUCGUU UGGGUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCC--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAACG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGAUGAUUAA ACCUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAC....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarA02_125 795 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........G CUAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A -ACU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UUAUUU-AU U--------- -------CUU AGGCCGUGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUU-C UAG-CCAAA- AUUAAGUU-- ---------- ---GAUA--- ---------- -----AAACA UCCUAAU-UG GUUAUUAAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG-U-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUAACCAC CUUAUAUUGA AAUACAAGGA GA-UUCUCUU UGUUG-AAAC AGUGUGA-UU UAUACUU-CA GUUUUAAA-- -UUCA---A- ----GAACCU AGCUUCUUGU UAUUCC-UUG UCUAAA---- ---------U UCA------- ----UUUUUA GAUUUGG-UU GACAGGACGC UGGGCUC--A CUGUGA-UC- ---------U CUUA------ -------GA- UCACAGAGAU G-UUCAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAGAAC -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUUAU UCUUUUGAUC UGACUAAUUA UUC------U UCAAA----- -------GAA UAAUUUUUUU GAUUCAAUAG AAAUAUG--U UUAA-UUCUU --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUAUAACC CAA------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG AAGUUAUAGA GG-UAAU--- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MarG06_H0 631 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UUUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UGA------- ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9314 1028 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AAYUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUU-CGU AA-UC-UGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUAUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UU-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UUAG-CAUC U-UUUAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9321 1003 bp rna ---------- ---------- ---------- --CUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAAGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUU --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UUUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAG UG-A------ ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC ACUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG CGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9322 1003 bp rna ---------- ---------- ---------- --CUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAAGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUU --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UUUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAG UG-A------ ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC ACUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG CGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9401 1032 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAAGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUU --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UUUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAG UG-A------ ---------- --------AU ---------- ---------- --------UC ACUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG CGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >SB 1033 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CA-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAAACUAUC CUGAUAACUA AAUUUCUGGA GA-AAAAAA- ---------U UGU-AGA--U GUGGCUU-AG AAUUGUCUAU UUGAAAA--- ----GAACCU AGCUUCUUGU CAUCU----- ---------- ----UUUUAU ---------- ---------- -----AG-UU GAUAAAAUGC UGGGCUC--G CAUGGA---- ---------- UUAUU----- ---------- -UCCAUGAG- AAUUCAGUA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG AU-------U A-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUAGU UCUGU-UUUU --AUAA---- UUUAG---CC UUAAAA---- ---------- CUAAAUUAUU UAAUUCUAGA AUUCAUG--U UUAA-UUCUU --GAGUAAUA GCCGAGCA-- CAAUUG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AUUUUG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UGAUU GUAUUAAA-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAUGUCUC GGGGAGCUGG AUACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGGC CAGCUGAAUA CAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAU UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAAACUAUC CUGAUAACUA AAUUUC-GGA GA-A---AAA U--------- -UUGUAG--A AGUGGCUUAG AAUUGUCUGU CUGAAAA--- ----GAACCU AGCUUCUUGU CAUCU----- ---------- ----UUUUAU ---------- ---------- -----AG-UU GAUAACAUGC UGGGCUC--G CAUGGA---- ---------- UUAAU----- ---------- -UCCAUGAG- AAAUCAGUA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG AU-------U A-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUAAU UCUGAUUUUU --UUAA---- UUUAG---CC UCAAAA---- ---------- CUAAAUUACU UAGAUCUAGA AUUCAUG--U UUAA-UUCUU --GAG-UAAA AGCCGAGCA- CAAU-UG--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AUUUU G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UGAUU GUAUUUAA-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAUGUCUC GGGGAGCUGG AUACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >PAC1 1124 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUUUAACC CUUGUGG-AG AAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AUA AAUU-GAUU- GUGAUGUCUA AG-------- -U-UAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGCAAU CCUGUCACCU UAA-GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUU-U UGA-AUUAG- ---U------ ---------- ---UUUAU-- ---------- ---------- ---AAUU-AA UUCUUUGAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGGUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGTGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGATGGC CCA------U UC--GTTGTT ---------- -------GGG GGUAUAGCTC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCT TUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAAACUAUC CUGAUAACUA AAUUCC-GGA GA-AAAAU-- ---------U UGUAUAA--G TCGGCUU-AG AAUUGUCUTT CUGAAAA--- ----GAACCU AGCUUCUUGU CAUCU----- ---------- ----UUUUAU ---------- ---------- -----AG-UU GAUAACAUGC UGGGCUC--A CAUGGA---- ---------- UUCAU----- ---------- -UCCAUGAG- AAUUCAGUA- GAACCUUGAA AACUGCAUAG AU-------U A-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUAAU UCUGGUUUUU --AUAA---- UUUAG---CC UUAAAA---- ---------- CUAAAUUACU UAAUUCUAGA AUUCAUG--U UUAA-UUCUU --GAGUAAAA GCCGAGCA-- CAAUUG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AUUUUG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UGAUU GUAUUUAA-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAUGUCUC GGGGAGCUGG AUACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >LG 1157 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGCAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -AUC-GAUU- GUGAUGUCUA AU-------- -U--UUCAAA A--------- -------UUU AGGCCAUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAGUA-A UAA-CUUAAA AAAUUGA--- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCACU UUAUAAA-UA GUUUUUAUUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAUUU--GGA GA-UUAUCGU ---------- -UUGUUUAAU GUGACUU-AG AGUUGUUCGU CUGAAU---- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUCC-U-- ---------- --------UU CUUUU----- ---------- ----AGG-CC GAUAAGACGC UGGGCUC--A ACUAAUAUUC ---------- UUCA------ -------GAU UAUUAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CACUGA AAUUUACUUA UUAAGC---- ---------- --AAA----- ---------- -----GCUAA AUAAAGAGAU UUCAAUG--C UUAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AUAU-- UUACUAAAAU UUAGUUAUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AAUAAC UUUUUAGUGA UUAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >SS2 1157 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCAGA GGCAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGCAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -AUC-GAUU- GUGAUGUCUA AU-------- -U--UUCAAA A--------- -------UUU AGGCCAUNAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAGUA-A UAA-CUUAAA AAAUUGA--- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCACU UUAUAAA-UA GUUUUUAUUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAUUU--GGA GA-UUAUCGU ---------- -UUGUUUAAU GUGACUU-AG A-GUUGUUCG UCUGAAU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUCC-U-- ---------- --------UU CUUUU----- ---------- ----AGG-CC GAUAAGACGC UGGGCUC--A ACUAAUAUUC ---------- UUCA------ -------GAU UAUUAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CACUGA AAUUUACUUA UUAAGC---- ---------- --AAA----- ---------- -----GCUAA AUAAAGAGAU UUCAAUG--C UUAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AUAU-- UUACUAAAAU UUAGUUAUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AAUAAC UUUUUAGUGA UUAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >SS35 1157 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCARCA AACUCGCGAG AGCAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGCAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -AUC-GAUU- GUGAUGUCUA AU-------- -U--UUCAAA A--------- -------UUU AGGCCAUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAGUA-A UAA-CUUAAA AAAUUGA--- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCACU UUAUAAA-UA GUUUUUAUUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAUUU--GGA GA-UUAUCGU ---------- -UUGUUUAAU GUGACUU-AG A-GUUGUUCG UCUGAAU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUCC-U-- ---------- --------UU CUUUU----- ---------- ----AGG-CC GAUAAGACGC UGGGCUC--A ACUAAUAUUC ---------- UUCA------ -------GAU UAUUAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CACUGA AAUUUACUUA UUAAGC---- ---------- --AAA----- ---------- -----GCUAA AUAAAGAGAU UUCAAUG--C UUAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AUAU-- UUACUAAAAU UUAGUUAUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AAUAAC UUUUUAGUGA UUAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >SS51 1157 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGCAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -AUC-GAUU- GUGAUGUCUA AU-------- -U--UUCAAA A--------- -------UUU AGGCCAUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAGUA-A UAA-CUUAAA AAAUUGA--- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCACU UUAUAAA-UA GUUUUUAUUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAUUU--GGA GA-UUAUCGU ---------- -UUGUUUAAU GUGACUU-AG A-GUUGUUCG UCUGAAU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUCC-U-- ---------- --------UU CUUUU----- ---------- ----AGG-CC GAUAAGACGC UGGGCUC--A ACUAAUAUUC ---------- UUCA------ -------GAU UAUUAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CACUGA AAUUUACUUA UUAAGC---- ---------- --AAA----- ---------- -----GCUAA AUAAAGAGAU UUCAAUG--C UUAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AUAU-- UUACUAAAAU UUAGUUAUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AAUAAC UUUUUAGUGA UUAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >SS120 1120 bp rna .......... .......... .......... .......... UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGCAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -AUC-GAUU- GUGAUGUCUA AU-------- -U--UUCAAA A--------- -------UUU AGGCCAUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAAGUA-A UAA-CUUAAA AAAUUGA--- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCACU UUAUAAA-UA GUUUUUAUUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A-CUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGCGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACUAC CUGAUAACUC AAUUU--GGA GA-UUAUCGU ---------- -UUGUUUAAU GUGACUU-AG A-GUUGUUCG UCUGAAU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUCC-U-- ---------- ------UUCU UUU------- ---------- ----AGG-CC GAUAAGACGC UGGGCUC--A ACUAAUAUUC ---------- UUCA------ -------GAU UAUUAGUUU- GAUUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GA-AAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-AG AUG-CACUGA AAUUUACUUA UUAAGC---- ---------- -AA-A----- ---------- -----GCUAA AUAAAGAGAU UUCAAUG--C UUAA-UUCUU --GAGUUA-G AGC-AUAU-- UUACUAAAAU UUAGUUAUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AAUAAC UUUUUAGUGA UUAUUAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUA UAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9211 1155 bp rna .......... .......... .......... ..CAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A -ACU-GAUU- AUGAUGUUUG GA-------- -U---AAAAA G--------- -------UUC AGGCCAUAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGGUUGAG AAC-UAUACA AAUCAUGA-- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UCAUU GAUUCUU-UA GUUUUUAAUU UCAGUU-CCU AAGCUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AACUU-- -UCU-UCU-- --------GG GCUAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCCACUGC CUGAUAACUC AAUUUAUGGA GA-UUGAUAU ---------- -UUGUUAAAU GUGAUUU-AG ACGUUGUUCA ACUGAUU--- ----GAACCU AGCUUCCUAU UA-CCC-U-- ---------- --------UU UUUAU----- ---------- --AAAGG-CU GGUAAGACGC UGGGCUC--A CUGUCCUU-- ---------- CUA------- --------AA GGACAGUUAA G-UUCAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAU GU--GAGUCU G-GAAAGAAU UAAAG-CAUC U--AAAU-AG AUC-CAUAAA UUCUAUUGAU ---------- ---------U CUA------- ---------- ---------- --UUAAUUGA AUUUAUG--U UCAA-UUCUA AUAA-UUAAG AGCCGAGA-- AAUUUAUUUG UUUAUUACUU CUAUAGAUGG A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAAUA ---------- ---------- ---------- ---------- ----UUCAUU UAUAAAAGUC UAAUAACCAU CAAAUAAAUU AACUAAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGAC CAGCUGAAUU CAUAGGCUGG AACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9313 1320 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCG AACUCGCGAG GGCAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGAAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -ACU-GAUC- GUGAUGUCUG AG-------- -U-UAUUGAU A--------- -------CUU AGGCCAUGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAGUUGAG AAU-CAAAGA AAAGCUGA-- ---------- ---GUAA--- ---------- -----UCAGC UUGGAGAUUG AUGAUUGAUU UUAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GACGAAUCUU CUG------- ---ACAACGA GC-CAAUGGU GAGAA-CCGU UGUGUGA--U GUGAUUU-AG AAUUUAAGUU UGCUGGC-A- ----GACCCU AGCUUCUUAU CAUUCC-AGG ACUCAA---- ------UCAA ---------- ------UUGA GAUGAGG-UU GAUAGGACGC UGGGCUC--A CUGUAAUUC- ---------- GCAA------ -------GAA UUGCAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUGAU UCUUGGGAAU CAGCUGAUGC AAUCUGC--- -GCGA----- ----GCAGAG AGCUGAGGUU GAUCAACGAG AAUGAUG--U UUGA-UUCUU --GAGUCAAG AGCCGAGA-- CUCUAUAGCG UUCUUUCGAU -GUCAUCGAG GCAUCGAGAG UUUGAUUGGU GAUUCAAACC AUCUUCAAUG ACAAACAAUU CAG------- -----UUUAA ---------C UGGAGAAGUU UGAGAUUGAA GCCAGGUAAA UUGCUAAGAA UACGUAUUCA ACUACGUGAA GCGUUAUAGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU AGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG ACACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9313genome 1261 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..CAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGAAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -ACU-GAU-C GUGAUGUCUG AG-------- -U-UAUUGAU A--------- -------CUU AGGCCAUGAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAGUUGAG AAU-CAAAGA AAAGCUGA-- ---------- ---GUAA--- ---------- -----UCAGC UUGGAGAUUG AUGAUUGAUU UUAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GACGAAUCUU CUG------- ---ACAACGA GC-CAAUGGU GAGAA-CCGU UGUGUGA--U GUGAUUU-AG AAUUUAAGUU UGCUGGC-A- ----GACCCU AGCUUCUUAU CAUUCC-AGG ACUCAA---- ------UCAA ---------- ------UUGA GAUGAGG-UU GAUAGGACGC UGGGCUC--A CUGUAAUUC- ---------- GCAA------ -------GAA UUGCAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--C-AU-GG AUG-CAUGAU UCUUGGGAAU CAGCUGAUGC AAUCUGC--- -GCGA----- ----GCAGAG AGCUGAGGUU GAUCAACGAG AAUGAUG--U UUGA-UUCUU --GAGUCAAG AGCCGAGA-- CUCUAUAGCG UUCUUUCGAU -GUCAUCGAG GCAUCGAGAG UUUGAUUGGU GAUUCAAACC AUCUUCAAUG ACAAACAAUU CAG------- -----UUUAA ---------C UGGAGAAGUU UGAGAUUGAA GCCAGGUAAA UUGCUAAGAA UACGUAUUCA ACUACGUGAA GCGUUAUAGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU AGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG ACACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MIT9303 1322 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGAAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UAUUUUAAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAGUUGAG AAU-CAAAGA AAAGCUGA-- ---------- ---GUAA--- ---------- -----UCAGC UUGGAGAUUG AUGAUUGAUU UUAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUU-- -ACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GACUGAUCUC CU-------- ---ACAACGA GC-CAAUGGU GAGAA-CCGU UGUGUGA--U GUGAUUU-AG AAUUUAAGUU UGCUGGA-A- ----GACCCU AGCUUCUUAU CAUUCC-AGG CCUCAA---- ------UUAA ---------- ------UUGA GGUUAGG-UU GAUAGGAUGC UGGGCUC--A CUGUAAUUC- ---------- GCAA------ -------GAA UUGCAGAGAU G-UUCAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U-UC-AU-GG AUG-CAUGAU UCUUGGGAAU CAGUUAAUGC AAUCUGC--- -GUCA----- ----GUAGAG AGCUGAGGUU GAUGAACGAG AAUGAUG--U UUGA-UUCUU --GAGUCAAG AGCCGAGA-- CUCUAUAGCG UUCUUUCGAU -GUCAUCGAG GCAUCAAGAG UUUGAUUGGU CAUUCAAACC AUCUUCAAUG ACAAACAAUU CAG------- -----UUUAA ---------C UGGAGAAGUU UGAGAUUGAA GCCAGGUGAA UUGCUAAGAA UACGUAUUCA ACUACGUGAA GCGUUAUAGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CAUGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU AGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG ACACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >C20 1225 bp rna CUACGG-ACA AAGAGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCUCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UAC-UUAAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AAUUUU-G AAG-UCAAGA A-UACAUA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UAU-G GAUUGCU-UG AUGGAAAUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA UCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUCUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-NUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC --------CU GAUCGAACUC AAUCUCCAUC UUCUGAAUGA -----UGGAA GGUGAACUCG AAUGUGA--U GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGCAU- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-GAA AUGACGGUG- --------AA U--------- -UAUCAUGAU CUUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA ACUGUU---- ---------- -U-------- --------AA GCAGUUUGAU G-UCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GAAAAAGUCU G-UAA-GAAU -AAAG-CAUC U-CUCAU-GG AUG-CAUCAU UCUU------ ---------- ---------- -UUU------ ---------- ---------- ------UAGG AUGAUGU--C AA---UUCUU --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCAUAA-CG UUCUUCUAAU U-GUGUCGAG CAAUUGGGAG UUUGAUGAUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCGUUCAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUUUUGGA GAUUAAAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGAGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH6501 1265 bp rna --UACGGACA AAGGGCAGCA AGUUCGCGAA GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGCGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UGCUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-UUAAGG A-UCAGCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGUUG AU-UGCU-UG AUGGAGAUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCAAAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUU GAUU-CCAUC U-CCAAUUUU G---UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU AAUUCC-AAG UUUUAGGU-- -------UGA U--------- ----GCCUUG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GG AUCAAAUGAU CAA------- GAAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UGGUGUCGAG CCAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUUA--- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UAAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUUAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACSCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC U-AAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8002 1266 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGCGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UGCUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-UCAAGG A-UCAGCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGUUA AU-CGCU-UG AUGGAGAUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCAAAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUU GAUUCCCAUC U-CCAAUUCU U---UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAG UUUUAGGU-- -------UAA A--------- ----GCCUUG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GG AUCAGGUGAU CAA------- GCAA------ --UUGGUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UGGUGUCGAG CUAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUUA--- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UAAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCAGUAA GCGUUCAGGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8005 1259 bp rna ---------- AANGGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGCGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UGCUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAA-UUAAGG A-UCAGCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGCUG AU-UGCU-UG AUGGAGAUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCAAAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUU GAUUCCCAUC U-CCAAUAUU U---UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAG UUUUAGGU-- -------UAA A--------- ----GCCUUG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GG AUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UGGUGUCGAG CCAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUUA--- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UAAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8012 1011 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UGCUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-UCAAGG A-UCAGCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGUUG AU-UGCU-UG AUGGAGAUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCAAAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGG CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGGAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUU GAUUCCCAUC U-CCAAUUUU U---UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAG UUUUAGGU-- -------UAA A--------- ----GCCUUG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GG AUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCCG AUCUUCU--- ---------- -AAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCCAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAAUG UUCUUU-GAU UGGUGUCGAG CCAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUUA--- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UAAA AACUUGAAAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8109 1266 bp rna --ACGG-ACA AAGGGCUGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGCGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC 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GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAAUG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUUA--- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UAAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGAGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAAUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >RS8015 1296 bp rna CUACGG-GCA AANGGCAGCA AGUUCGNGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AAUUUAC U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UCAGUCGUUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC --------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCG AUUGUGAAGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA GG-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAGA------ --UUGAUCAU UGGAUUUGCA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGGUGAUUAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCA-CGAAC NGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8102genome 1236 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...AGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UACUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AACCA-CUCG AUUGUGAAGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAG U------UAG UUU------- -ACUUAAUUG 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...CAAGGUA NCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCWCCY UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAS-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA AGAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC AAGUUGGUAG AGCGCCUGCU UUCCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCG AUUGUGAAGU GUGAUUU-AG AUGUGUCCC- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA GA-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAGA------ --UUGAUCAU UGGAUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCACC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGGUGAUUAA AGCUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU SGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU WA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8113 1298 bp rna ACCGGACAAA GGGCAAGCAA AGUUCGCGAG GACAAGCAAN UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UCC-GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAA AGCCA-CUCG AUUGUGAUGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA GG-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAGA------ --UUGAUCAU UGGAUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCUGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAUC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGAUGAUUAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCMCGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8406 1287 bp rna ---------A ACUGGCANCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCC-UAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUUAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UCC-GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCCCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC --------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCG AUUGUGAAGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCGAAGUAAA GG-------A UU-------U UACUUGAACG AAUUUGGGUU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA UUUCAAUGAU CAA------- GAAA------ --UUGAUCAU UGGAUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUAAAUCUG AUCUUCU--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAGCG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-CUU GUUUUAGGAA UUAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGAUGAUUAA AACUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAGCACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG UACGAGCCAA CCCAGCGAAC U-AAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8015 1266 bp rna ---------- -CANGGCASA NGUUCSCGAG G-CAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-UAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCAAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACUUU-G AAG-CUAAGA GAGUUCCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGGUU GUCUGCU-UA GUGUAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGUUCACA ACCCAUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUA ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACU-ACC-A AAUCCCCAUC U-CCAAAACC -----UGGAG UAUGAACUCG UAUG-GA-UU GUGAUUU-AG AUUUGUCC-- -GCUAGA-U- ----GACCCU AGCUUCUUGU CAUUUU-AAG CUAUGGAA-- ---------A UGA------- --UUCCAUGA U-UUGA--UU GAUAGGAUGC UGGGCUC-GA UGCAAUGUAU UGA------- GAGA------ --UUAAUGCA UUGUUUUGAU G-UCUAGCC- GAACCUUGAC AACUGCAUAG UU-UAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--UUAU-GG AUG-CAUCAU UUUUUCGUGU ---------- ---------- -UAAC----- ---------- ---------- GCAUGAAAGA GUGAUGU--U AA---UUCUA --AAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAGUAUG UUCUUU-CAA AUGUGUCGAG CGUUUGAGAG UUUGAU-UUU AAUUUCUAGU UUUAGGAGCU A--------- ---------- -----UUUUU ---------- ---------- ---AGAGUCU AAUUUUAGAA AUUAGAAAAA UCUG-UUUCA ACAACAGCAA GCGUGCUGGA GAUACAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8016 1268 bp rna ---------- AANGGCAGCA NGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-UAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCAAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACUUU-G AAG-CUAAGA GAGUUCCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGGUU GUCUGCU-UA GUGUAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGUUCACA ACCCAUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUA ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACU-ACCAA AAUCCCCAUC U-CCAAAAC- -----UGGAG UAUGAACUCG UAUG-GA-UU GUGAUUU-AG AUUUGUCC-- -GCUAGA-U- ----GACCCU AGCUUCUUGU CAUUUU-AAG CUAUGGAA-- ---------A UGA------- --UUCCAUGA U-UUGA--UU GAUAGGAUGC UGGGCUC-GA UGCAAUGUAU UGA------- GAGA------ --UUAAUGCA UUGUUUUGAU G-UCUAGCC- GAACCUUGAC AACUGCAUAG UU-UAAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--UUAU-GG AUG-CAUCAU UUUUUCGUGU ---------- ---------- -UAAC----- ---------- ---------- GCAUGAAAGA GUGAUGU--U AA---UUCUA --AAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAGUAUG UUCUUU-CAA AUGUGUCGAG CGUUUGAGAG UUUGAU-UUU AAUUUCUAGU UUUAGGAGCU A--------- ---------- -----UUUUU ---------- ---------- ---AGAGUCU AAUUUUAGAA AUUAGAAAAA UCUG-UUUCA ACAACAGCAA GCGUGCUGGA GAUACAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACNUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8020 1248 bp rna CUACGGACAA AGGGCAAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-UUUCUAU U--------- -------CUU AGGCCAAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACUUU-G AAG-CUAAGA G--UUCCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGGAU GACUGCU-UA GUGGAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGUUCACA ACCCAUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGNGUA ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC --------CU GACUGCAAUG AAUCCCCAUC U-CCAAAGCC -----UGGAG UAUGAACUCG UAUG-GA-UU GUGAUUU-AG AUAUGUCC-- -GCUAGA-U- ----GAUCCU AGCUUCUUGU CAUUUU-A-G GCAUGGAC-- --------AU UG-------- --U-UCCAUG AUUUGA--UU GAUAGGAUGC UGGGCUC-GA UGCAAUGGAU UGA------- GAGA------ --UCAAUCCA UUGUUUUGAU G-UCUGGCC- GAACCUUGAC AACUGCAUA- GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U---CAU-AG AUG-CAUCAU UCUUAAGUGU ---------- ---------- -UAAU----- ---------- ---------- -UCACUUUAG GAUGAUG--- UUAA-UUCUA -AGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAGCAUG UUCUUU-CAA AUGUGUCGAG CAUUUGAGAG UUUGAU-UUU AAUUUC---- ---------- ---------- ---------- -----UACUU ---------- ---------- ---------- ----GUGGAA AUUAGAAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUGUUGGA GAUACAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH9908 1239 bp rna ---------- ---GGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCCCAUAAAC CGUAGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -UUUAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCAAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACUUU-G AAG-CUAAGA GA-AUCCA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UGGAU CUCUGCU-UA GUGGAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGUUCACA ACCCAUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUA ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACU-ACCCA AAUCCCCAUC U-CCAAAGCC -----UGGAG UAUGAACUCG UAUG-GA-UU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUAGA-U- ----GACCCU AGCUUCUUGU CAUUUU-AAG GCAUGGAA-- ---------A UGA------- --UUCCAUGA UAUUUAA-UU GAUAGGAUGC UGGGCUC-GA UGCAAUGUAU UGA------- GAGA------ --UCAAUGCA UUGUUUUGAU G-UCUGGCC- GAACCUUGAC AACUGCAUA- GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U--UUAU-GG AUG-CAUCAU UCUUGAGUGU ---------- ---------- -UAAU----- ---------- ---------- UCACGAUGGA AUGGUGU--U AA---UUCUA ---AG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAGCAUG UUCUUU-CAA AUGUGUCGAG CAUUUGAGAG UUUGAU-UUU AAUUUC---- ---------- ---------- ---------- -----UACUU ---------- ---------- ---------- ----GUAGAA GUUAGAAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUGUUGGA GAUACAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC UUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH7805 977 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........GG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG GAGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AAUUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAA GUGAGGA-UG GUGGAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCUGAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCAAACUG UAUCCCCAUC U-CCAAAAGG AA--UUGGAG UAUGAAUUCG AUUG-GA-GU GUGAUUUUAG ACGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UGAAAGCAAA A-------AA A-------UU UUGCUAGUUA AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA GUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U-CUCAU-GG AUG-CAUCAU UCUU------ ---------- ---------- -UUU------ ---------- ---------- ------AAGG AUGAUGU--C GA---UUCUU --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUUUGAU U-GUGUCGAG CAAUCAAGAG UUUGAUUUUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCAGGAAGAA UCUG-UUUCA ACAACAGCAA GCGUGUUGGA GAUUAUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8008 999 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....AGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AAUUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAA GUGAGGA-UG GUGGAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCUGAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCAAACUG UAUCCCCAUC U-CCAAAAGG AA--UUGGAG UAUGAAUUCG AUUG-GA-GU GUGAUUUUAG ACGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UGAAAGCAAA A-------AA A-------UU UUGCUAGUUA AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA GUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U-CUCAU-GG AUG-CAUCAU UCUU------ ---------- ---------- -UUU------ ---------- ---------- ------AAGG AUGAUGU--C GA---UUCUU --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUUUGAU U-GUGUCGAG CAAUCAAGAG UUUGAUUUUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA 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UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AAUUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAA GUGAGGA-UG GUGGAGAUUU UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCUGAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCAAACUG UAUCCCCAUC U-CCAAAAGG AA--UUGGAG UAUGAAUUCG AUUG-GA-GU GUGAUUUUAG ACGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UGAAAGCAAA A-------AA A-------UU UUGCUAGUUA AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA GUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUGAU UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U-CUCAU-GG AUG-CAUCAU UCUU------ ---------- ---------- -UUU------ ---------- ---------- ------AAGG AUGAUGU--C GA---UUCUU --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUUUGAU U-GUGUCGAG CAAUCAAGAG UUUGAUUUUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCAGGAAGAA UCUG-UUUCA ACAACAGCAA GCGUGUUGGA GAUUAUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC UAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >RS9705 1268 bp rna --ACGG-ACA AAGAGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCUCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UACUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AAUUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAG GUGAGGA-UG GUGGAAAUUC UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU G--------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUG -AUCCCCAUC U-CCAAGAUG ----UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-A- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA GACAAGUAAA --------AA G--------U UUACUUGUUG ACUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-AA AUGAGUUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUCAA UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U---CAU-GG AUG-AUGCGA UGAUUCUUUU CUGUGAUCC- ---------- -GAAA----- ---------- -----GGAUG AUGGAGAAGG AGAGUUG--C AAA--UUCUA UCGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUU-CAA UUGUGUCGAG CAAUUGCGAG UUUGAUUCUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCAGGGAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUGUUGGA GAUUAUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGAGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCA-CGAAC U-AAACAUCU -A........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >RS9708 1275 bp rna CUACGGACAA AAGAGCAGCA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCUCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UACUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AAUUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAG GUGAGGA-UG GUGGAAAUUC UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU G--------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUG UAUCCCCAUC U-CCAAGAUG ----UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-A- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA GACAAGUAAA --------AA G--------U UUACUUGUUG ACUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-AA AUGAGUUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUCAA UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U---CAU-GG AUG-AUGCGA UGAUUCUUUU CUGUGAUCC- ---------- -GAAA----- ---------- -----GGAUG AUGGAGAAGG AGAGUUG--C AAA--UUCUA UCGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUU-CAA UUGUGUCGAG CAAUUGCGAG UUUGAUUCUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCAGGGAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUGUUGGA GAUUAUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGAGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH7803 1272 bp rna --ACGGGACA AAGACAGCAA AGUUCGCGAG GACAAGCAAA UCUCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CU-CGGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UACAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAG-CCAUCA AACUUGCA-- ---------- ---GCGA--- ---------- -----UGCAG GUGAGGA-UG GUGGAGAUUC UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUG UAUCCCCAUC U-CCAAGAUG ----UUGGAG U-UGAGCUCG AUUG-GA-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-A- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA GACAAGUAAA --------AA C--------U UUACUUGUUG ACUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-AA AUGAGUUGAU CAA------- GCAA------ --UUGAUCAA UUGAUUUGAA GUUCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U---CAU-GG AUG-AUGCGA UGAUUCUUUU CUGUGAUCC- ---------- -GAAA----- ---------- -----GGAUG AUGGAGAAGG AGAGUUG--C AAA--UUCUA UCGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUCACG UUCUUU-CAA UUGUGUCGAG CAAUUGCGAG UUUGAUUCUU GAUUCA---- ---------- ---------- ---------- ------GCAA ---------- ---------- ---------- ------UGAA UCAGGGAGAA UCUG-UUUCA ACGACAGCAA GCGUGUUGGA GAUUAUAU-- -GGUCAAGCU ACAAAGAGCU CACGGCGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGUACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >EBAC392.2 794 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......A--- -----CAGGG -AGACA-AAA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACAUU-U UU--UCAAAG AAUGAUGA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCAUC AAGAGAU-UG AAAGAGAUGU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAAGA GUCC-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCAUU GUCCGGUUAC CC-GGAGGAU GAA---CUCG AGGGAA---U GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -ACUAGAUUG ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUGCC-AGA UAAGCAA--- -------UUU U--------- ------UGCU UGAUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-AG AUUAAUC--- ---------- GAAA------ --------GA UUAAUUUGAU G-UCUAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAA-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUAAGGCUG AAUUCUC--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAAU UUAGUAUUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUAGAUG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUUGAU-UUU GUUUUUAUGA GCAAC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGUUGAUGAA ACCAGAAAAA UCUGCUUUCA ACCGCAGUAA GCGUUUAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MB11A04.2 793 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......A--- -----CAGGG -AGACA-AAA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACAUU-U UU--CCAAAG AUUGAUGA-- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UCAUC AGGAGAU-UG GAAUUGAUGU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GG-AAGA GUCC-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCAUU GUCCGGUAAC UC-GGAGGAU GAA---CUCG AUGGCG---U GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -ACUAGAUAG ----GACCCU AGCUUCCUGU CAUUCC-GAA CAAGUGA--- -------UUA U--------- ------UACU UGAUUGG-UU GAUAUGAUGC UGGGCUC-AG AUUAAUC--- ---------- GAAA------ --------GA UUAAUUUGAU C-UCUAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAA GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -AAAG-CAUU U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUAAGUCUG AAUUCUC--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GAGAGU UUGGAUCUAG AACGAUG--A AAA--UUCUU UUAAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUAGAUG UUCUUUUUA- UCGUGUCGAG CGAUAAAGAG UUUGAU-UUU GUUUUUAUGA GUAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGCUGAUGAA ACCAAAAGAA UCUGCUUUCA ACCGCAGUAA GCGUUUAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >MB11E09.2 794 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......A--- -----CAGGG -AGACA-AAA CAAU-GAUU- UUGAUGUCUG AG-------- -U-AUUUCAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AACAUU-U UU--CCAAAG AUUGGUGA-- ---------- ---GCAA--- ---------- -----UCAUC AAGAGAU-UG GAAGGGAUGU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAAGA GUCC-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACAGAACUC AAUCUCCAUU AUCCGGUAAC UC-GGAGGGU GAA---CUCG AUGGCG---U GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -ACUAGAUAG ----GACCCU AGCUUCCUGU CAUUCC-GAA CAAGUGA--- -------UUA U--------- ------UGCU UGUUUGG-CU GAUAUGAUGC UGGGCUC-AG AUUAAUC--- ---------- GAAA------ --------GA UUAAUUUGAU C-UCUAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAA GU--AAGUCU G-GAAA-AAC -GAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUAAGUCUG AAUUCUC--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GAGAGU UUAGAUCUAG AAUGAUG--A AAA--UUCUU UUAAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUAGAUG UUCUUUUUA- UCGUGUCGAG CGAUAAGGAG UUUGAU-UUU GUUUUUAUGA GCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGCUGAUAAA ACCAGAAGAA UCUGCUUUCA ACCGCAGUAA GCGUUUAAGA GGUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH8101 1265 bp rna ---------- -----GGCAG CAACUCGCGA CNCUAGCAAA UCCC-UAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGCCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA--CA CAAU-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UACUUUUAU U--------- -------CUU AGGUCAAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCUUU-G AAUUCAUCUG A-UUUGUA-- ---------- ---GAAA--- ---------- -----UACAA AUGGAGA-UG GAAUCAAUUC UUAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCAAAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAUGA GACU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UCC-GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACGU GAUCCCCAGC U-CCUAUUUU ----UUGGAG U-UGAAUGAU UUUG-GU-GU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGG-A- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCU-GAG AUUCAAUC-- ---------A UG-------- ----GAUUGA AUUUUAG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUC-GA AUCAGGUGUC AGGGUUAUC- GCGA-GAUAG CUUUUUCGUU UUGAUUUGAA G-UCUAGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAGAAU -AAAG-CAUC U---CAU-GG AUG-AUGCAU UCUUUCAGUA UUGUUACCC- ---------- -GAAA----- ---------- ---GGGUGAU GGUAAUGAGA GGAUGUG--A A----UUCUA --GAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCCAUGGUG UUCUUCUGCU U-GUGUCGAG CAAGUGGGAG UUUGAUUGUU GAUUCU---- ---------- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- ---------- ------GGAA UCAAUGAGAA UCUGUUUUCA ACAACAGCAA GCAUGAUGGA GAUUAAUUU- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUNGAACGGC UACCUGAAUC CAUAGGGUAG CGCGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >WH5701 1352 bp rna CUACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CGCAAGGGAG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA--AU AACU-GAU-C GUGAUGUCUG GC-------- -U-CAUUUAU U--------- -------GCU AGGCCAUGAU CCUGUCAUCU CGAUGGUUAA UCGGUACCUC --AACCGACA GAGACGAAGC CAGAUGU-GA AUCCA----- ---GCGA--- -----UGGAG AGACCUCUGA GCUGUCC-GU GGAUGUCUUU UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCAC- C-CCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- -UAUCCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UCC-UGUUU- ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGNAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------CU GACCAACCCG CCCGGA-UCG CGAAASCAGA -G-GGAGAGA AGCUUGUGGU GGUGAUUUU- AGAUGAUUGU ACU-GAGAAA AG-------- ----GACUCU AGCUUCCUUU CAUUUUAAGG UUUGAUCAGU AUCUUGAU-G CGA-GUCAAG UACUGCCAUA GGCCUUGAUU GAAAAGACGC UGGACUC-CA GCAAGAUCAG CU-------- GAAA------ -----GGCUG AUGGUUGCGG UGUUCAGUA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-UAA---AU -AAAG-CAUC U---CAU-GG AUG-CUUCAU CAGCAGUCGA UGAUUCUGGU GGC------- -UUUG----- --------GC UCCUGGGAUC AACGUUUGUU UUUGGAG--C GA---UUCUA --GAG-UAGG AGCCGAGA-- CUCCACAUUG CUCCUGGUUC UU--GCCGAA AGAAU-CGGG UUUGAU-CUU GUUUUUAGAG UCAAUGCGAG AUCAAUUGAA ---------- ------GAAA ---------- --UUCAGUUG AUCAGGCGUU GAGGAUGAAA GCAGGAGAAU CUGCGUA-CA ACCGCAGUAA GGUGAUGUGG AGAUAAAUU- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCUUGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU AGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGCUGG AAACACGCUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CUAGAACGGC CAGCUGAAUC CAUAGGCUGG CACGAGCCAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... . >PCC6307 1507 bp rna GCUACGGACA AAGGGUUGCA AGCUCGCGAG AGUUAGCUAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGGAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG GAGACA---C AACU-GAUC- GUGAUGUCUG AGCGCCGACC AAGCGUAAGU UUGGGAAGCA CCUUUGUCUC AGGCCACGGU CCUGUCAUCU CGAAGGUCGA UCGGUACCUC --AAGGUGAG CCAUCAAAGC CAAGGGAAGA GUCCAGAAGG CUCGCAAGAG CAGGAAGGAG GAUUCUGAGG AUGUUGUGAU GGACUCGUUU UCAGUUUCCU AAACUUUGUU CUAGGUCAC- CCCACCAAGG GUUCUGCCAG ACAGCCAACG UUUUCGGUCC CGCCAGGGAG AGGAAACGAU GGGUGGCUGG GGGAGCCACU GUCAGAGUGA UUGUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUGUUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC 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AAGCCGAAAG GCGAGCTAGG TTGCGGCGAG AGCTCCTGGG CCATTAGCTC AGGTGGTTAG AGCGCACCCC TGATAAGGGT GAGGTCCCTG GTTCAAGTCC AGGATGGCCC ATTCGTGTTT GGGGGTTTAG CTCAGTTGGT AGAGCGCCTG CTTTGCAAGC AGGATGTCAG CGGTTCGAGT CCGCTAACCT CCATCCAATA ATGATGCTCA TCCCTCAATC TGTAACTGCA AGTTTTGCGG TAAGGAGTTT AGCTGTGTTT GTGATCTTGA CTGTTGTTCG CTGAAGATTT CAGCTTCTTT TCATTCTTAA TGAGTTAACC AGATAGCTGG TTAGTAAGTT TGGTTGAAAG GACGCTGGAT TCAATCCTGC CCTGGAGACA GGGCTGTTTG AATGTCAGCA GAACCTTGAC AACTGCATAG GTAAAGTCTG GAAATAAAGC ATCTCATGGA TGCTTGATTC CGGCTTGAGT TCCATCCAGC AATGGATATG GCTTAAAGCT GGTATCAAGA AAATTCTATT GAGTTTTTAG AGCCGAGAGC TTCCAGTTTT CTTCTGAGCC CGCCGAGGGT TTGGGAGTTT GATCCTGGCA TTCAAACCGC ATTAGGTGCT CAAAGAGATT TGAGTATTAA GTGTAGGTGA ATCTAGAGAG AATAGGCCTC AACAGCCTGA AGAACTGGGA GTTGAAATTG GTCAAGCTAC AAAGGG.... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >X52169 1473 bp rna AGAGTTCGAT CCTGGCTCAG GATGAACGCT GGCGGCGTGC TTAACACATG CAAGTCGAAC GAACCTTCGG GTTAGTGGCG GACGGGTGAG TAACGCGTGA GAATCTGCCC TCAGGAGGGG GATAACGGTT GGAAACGACC GCTAATACCC CATATGCCGA TAGGTGAAAT GAATTTCGCC TGAGGATGAG CTCGCGTCTG ATTAGCTTGT TGGTGAGGTA ATGGCTCACC AAGGCTTCGA TCAGTAGCTG GTCTGAGAGG ATGATCAGCC ACACTGGGAC TGAGACACGG CCCAGACTCC TACGGGAGGC AGCAGTGGGG AATTTTCCGC AATGGGCGAA ACGTGACGGA GCAACGCCGC GTGAGGGACG AAGGCCTCTG GGCTGTAAAC CTCTTTTTTC AAGGAAGAAG ATATGACGGT ACTTGAGGAA TAAGCCACGG CTAATTCCGT GCCAGCAGCC GCGGTAATAC GGGAGTGGCA AGCGTTATCC GGAATTATTG GGCGTAAAGC GTCCGCAGGC GGCCTTTCAA GTCTGCTGTT AAAGCGTGGA GCTTAACTCC ATTATGGCAG TGGAAACTGA TCGGCTTGAG TATGGTAGGG GCAGAGGGAA TTCCCGGTGT AGCGGTGAAA TGCGTAGATA TCGGGAAGAA CACCAGTGGC GAAGGCGCTC TGCTGGGCCA TTACTGACGC TCATGGACGA AAGCCAGGGG AGCGAAAGGG ATTAGATACC CCTGTAGTCC TGGCCGTAAA CGATGAACAC TAGGTGTCGG GGGAATCGAC CCCTTCGGTG TCGTAGCTAA CGCGTTAAGT GTTCCGCCTG GGGAGTACGC ACGCAAGTTG AAACTCAAAG GAATTGACGG GNNNCCGCAC AAGCGTGGAG TATGTGGTTT AATTCGATGC AACGCGAAGA ACCTTACCAG GGTTTGACAT CCTGAGAACC TCTTAGAAAT TTGAGGGTGC CTTCGGGAAT TCAGTGACAG GTGGTGCATG GCTGTCGTCA GCTCGTGTCG TGAGATGTTG GGTTAAGTCC CGCAACGAGC GCAACCCACG TTTTTAGTTG CCAGCATTTA GTTGGGCACT CTAGAAAGAC CGCCGGTGAT AAACCGGAGG AAGGTGTGGA TGACGTCAAG TCATCATGCC CCTTACACCC TGGGCTACAC ACGTACTACA ATGCTACGGA CAAAGGGCAG CACACTCGCG AGAGCTAGCA AATCCCATAA ACCGTGGCTC AGTTCAGATC GTAGGCTGCA ACTCGCCTAC GTGAAGTAGG AATCGCTAGT AATCGCAGGT CAGCATACTG CGGTGAATAC GTTCCCGGGC CTTGTACACA CCGCCCGTCC CACCATGGAA GTTGGCCATG CCCGAAGTCG TTACTCCAAC CCTTGTGGAG GAGGACGCCG AAGTGGGGCT AATGACTGGG GTGAAGTCGT AACAAGGTAG CCGTACCGGA AGGTGGGGCT GGATCACCTC CTT....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_10 1033 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACTCGCGAG AGCTAGCAAA TCCCATAAAC CGTGGCTCAG TTCAGATCGT AGGCTGCAAC TCGCCTACGT GAAGTAGGAA TCGCTAGTAA TC-GCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCGT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACGTTC-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TT--CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-CT-GGTA GA-AAGGAA- ---------- --ATGTTTTG AGTTGTGATC AATATT---- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CATGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_1 836 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......C-T TAA------- ---------- ---------- --TTTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TT--CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-TT-TTGA GA-AAGGAAA ---------- --ATTTA--G AGTTGTGACA CAATT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CATGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TAGTAGCTGG AGGAAGAGAA AGTAAATAAC GACTCCCTCA GTAGCGGCGA GCGAACGGGG AACAGCCCAA ACCGATAGTC TTGACTATCG GGGTTGTGGG ACAGCAATAT GGATCAATAA ATCTAGAAGA AACGTTTGAA TGGCGTGCCA CAGAGGGTGA AAGCCCCGTA ATC....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_9 664 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACTCGCGAG AGCTAGCAAA TCCCATAAAC CGTGGCTCAG TTCAGATCGT AGGCTGCAAC TCGCCTACGT GAAGTAGGAA TCGCTAGTAA TC-GCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCGT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACATTC-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGGATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTTAT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TT--CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTGC-CAT AA-TC-TTGA GA-AAGGAA- ---------- --ACTTATTT AGATGTGATC AAAAT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCT.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_11 586 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGUU-- ---------- --------UA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUU --ACAUUC-U UAAA------ ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------C. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_5 587 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........G GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACGTTC-T TAA------- ---------- ---------- ---CTAA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TCAATT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TTT-CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATCACCA-C CTCTTC-CAT AT-TT-TGTA GA-AAGGAAA ---------- --TTTTTT-G AGTTGTGATC AACTT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCCTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------GC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- ATTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTTT GC-------- ---------- -AAAT----- ---------- --------GC ATTAA-ATAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTA.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_16 382 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ........C- AA-UU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGUAA ---------- ---------- --------CC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA--UAA CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------UG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC U......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_7 411 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..TGTTTT-G AGTTGTGATC TAATT----- CTGAAC---- ----GAATCT TTCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TT ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT TTAAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CATGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_17 430 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....C-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAA- ---------- ---AUUUUGA GUUGUGAUCU AA-UU----- CUGGAC---- ----GAAUCC AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UCAAA C--------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA--UAA CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_18 357 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ...AAGAUGC UGGACUC--A UGGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA--UAA CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGACGU GGUUACCUGC GAUAAGUCUC GGGGAGUUGG AAGCACACUU UGAUCCGGGA AUUUCCGAAU GGGGCAACCC CAUGUACGGC CAACUGAAUA UAUAGGUUGG UGCGAGCUAA CCCAGCGAAC UGAAACAUCU UA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_6 442 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....ACCA-C CTCTTC-CAT AA-TC-CGGA GA-AAGGAAA ---------- --TGTTTT-G AGTTGTGATC AAATT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TAATTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-CTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -AAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT GCCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CATGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TA........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_2 951 bp rna .......... .......AGC AACTCGCGAG AGCTAGCAAA TCCCATAAAC CGTGGCTCAG TTCAGATCGT AGGCTGCAAC TCGCCTACGT GAAGTAGGAA TCGCTAGTAA TC-GCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCGT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACGTTT-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TTT-CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-CC-GGTA GA-AAGGAAA ---------- --TGTTTT-G AGTTGTGATC AAATT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGGAGTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGC..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_4 911 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..GTAC-CAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCTT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA -T-------- -------ATT AT-----TAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACGTTC-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTG--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TTT-CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-TC-CGTA GA-AAGGAAA ---------- --TGTTTT-G AGTTGTGATC -A-TT--ATT CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CTTGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TAGTAGCTGG AGGAAGAGAA AGTAAATAAC .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_15 795 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....CCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGUU-- ---------- --------UA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UUU CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUA-CAU AA-UC-UGAU AA-AGGAAA- ---------- --UGUUUUGA GUUGUGAUCA AA-UU----- CUGAAC---- ----GAUUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGAAA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAA-UAA CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGAGGAU ACCUAGGCAC ACAGAGGCGA UGAAGGAUCG UGGUUACCUG CGAUAAGUCU CGGGGAGUUG GAAGCACACU UUGAUCCGGG AAUUUCCGAA UGGGGCAACC ACCAUGUACG GCCAACUGAA UAUA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_12 836 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACTCGCGAG AGCTAGCAAA TCCCATAAAC CGTGGCTCAG TTCAGATCGT AGGCTGCAAC TCGCCTACGT GAAGTAGGAA TCGCTAGTAA TC-GCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCGT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACATTC-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGGATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTTAT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TT--CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTGC-CAT AA-TC-TTGA GA-AAGGAA- ---------- --ACTTATTT AGATGTGATC AAAAT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGAAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--T-TTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATT T-TTAAT--A ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -AAAT----- ---------- --------GC ATTTAA-TAA ACATTCT-AT TTAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TTTG A......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_3 891 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....A-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA AT-------- -------ATT AT-----TAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTATCTC --ACATTT-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGAATT TTATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TTT-CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-AT-CTTA GA-AGGGAAA ---------- --TGTTTT-G AGTTGTGATC ACCTT----- CTGAAC---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----TGTAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATTTT T-AAAGACAA -TAAG-CATC T-TTAAT--G ATG-CAGATT TATTATTTGT GC-------- ---------- -GAAT----- ---------- --------GC ATTAA--TAA CAATTCT-AT TAAGCT---- ---------- ---------- GATGCTTCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTG AAGTTATT-- -GGTCAAGCT ACAAAGGGCT CACGGAGGAT ACCTAGGCAC ACAGAGGCGA TGAAGGACGT GGTTACCTGC GATAAGTCTC GGGGAGTTGG AAGCACACTT TGATCCGGGA ATTTCCGAAT GGGGCAACCC CATGTACGGC CAACTGAATA TATAGGTTGG TGCGAGCTAA CCCAGCGAAC TGAAACATCT TAGTAGCTGG AGGAAGAGAA AGTAAATAAC GACTCCCTCA GTAGCGGCGA GCGAACGGGG AACAGCCCAA ACCGATAGTC TTGACTATCG GGGTTGTGGG ACAGCAATAT GGATCAACAA GTCTAGAAGA AGCGTTTGAA TGGCGTGCCA TAGAGGGTGA AAGCCCCGTA A......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_13 743 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGUU-- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUU-UUU CUAGGUCACA CCCAUUUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------U-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AUAUU-UAUA GA-AGGGAA- ---------- --AUUUUUUG AGUUGUGACC AAAUC----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UAGUU ---------- ---------- --------CU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUA A......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_8 741 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACTCGCGAG AGCTAGCAAA TCCCATAAAC CGTGGCTCAG TTCAGATCGT AGGCTGCAAC TCGCCTACGT GAAGTAGGAA TCGCTAGTAA TC-GCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCATGC CCGAAGTCGT TACTCCAACC CTTGTGG-AG GAGGACGCCG AAGGTGGGGC TAATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AATGTT-- ---------- --------TA ---------- -------ATA TT---ATTAT TTTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTACCTC --ACATTC-T TAA------- ---------- ---------- ---TTTA--- ---------- ---------- ---------- -TTAAGGATT TCATTT-CCT AAGTTT-TT- CTAGGTCACA CCCATTAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------TT-- -TT--CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA-----TA TCTCTATGTT ---------- -------GGG GGTATAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTTACCTCC A-------CT GATTACCA-C CTCTTC-CAT AA-TC-TTTA GAAAGGGAA- ---------- --TTTTTT-G AGTCGTGACC AAATT----- CTGAAA---- ----GAATCT AGCTTCCTA- ---A------ ---------- -----ATGAA ---------- ---------- --------TC ATTAAGATGC TGGACTC--A TTGAA----- ---------- TTAAT----- ---------- --TTCATTG- TTTTCAG-A- GAACCTTGAC AACTGCATAG AT--TATT.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_14 621 bp rna ..ACGG-ACA AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCAUGC CCGAAGUCGU UACUCCAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGUU-- ---------- --------UA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UGUA GAAAGGGAA. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_20 949 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....GG-AG GAGGAUGUCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA UCCGUACCGG AA-GGUG-CG GAUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-A-A CAAC-GAUU- UUGAUGCCUG AG-------- -UAGUUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGAAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGCGUU-G AAG-CAACAG AGUCAACA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----UGUUG AUGCGUG-UU GUGGAGAUGA UCAGUU-CCU AAACUUUGU- CUAGGUCACA CCCCACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGUUGA GUUUUCCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GGUGUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGGA GUUCGAGUCU CCUAACCUCC A-------CU GACCGAACUC AAUCUCCGGU UUUGCAUUGA AA-GAUGGAG AGCCA-CUCG AUUGUGAUGU GUGAUUU-AG AUGUGUCC-- -GCUGGA-U- ----GACCCC AGCUUCCUGU CAUUCC-AAA UCAGGGUAA- -------AGG UUU------U UACUCGAAUA AAUUUGG-UU GAUAAGAUGC UGGGCUCGAA UUCAAAUGAU CAA------- GCAA------ -UUGGUCGUU UGGGUUUGAA G-UCUGGCA- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GAAAAAAC -AAAG-CAUC U---UAC-AG AUG-CAUUGU UUUGAAUCUG AUCUUCC--- ---------- -GAAA----- ---------- ----GGGAGA UUGGAUCUAG AACAAUG--A AAA--UUCUU UUGAG-CAAG AGCCGAGA-- CUCUUGAACG UUCUUU-GAU UCGUGUCGAG CGAAUCAGAG UUCGAU-CUU GUUUUAGGAA UCAGC----- ---------- ---------- ------GAAA ---------- ---------- --------GU UGAUGAUUAA ACCUUGAGAA UCUGCUUUCA ACGGCGGUAA GCGUUCAGGA GAUUAAUU-- -GGUCAAGCU ACAAAGGGCU CACGGUGGAU ACCU-GGCAC ACAGAGGCGA UGAAG..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_21 4005 bp rna ACCACCGCTT TAACGGCAAC CTGGCGACTC TTTGATGGTG GACGGGCCAG GGCTGAGTAC CGCCGTTTCA AGCGAGCCGC CGAGGAGAGC GCCTACAACT TTGCGTCGAC ACGTGATGGC ATCCGGTTTG AGGTTGAGCA GAGCTTCATC AACCTGCGCT CAGCCATCCA GAACATCGAG ACCACATCGA GTGAAGTCTT GTCCTCCCGA GAGTCACTGC GGTTGTCTCA ACTACGGGTG CAGGCGGGTG TGAGCACACA GCGGGAAGTC GTAGACAACC AGCGTGACCT CACCAACGCT GAGATCCGCT ATGCCCAGCG CGATCCGCGA GTACAACACC AGCCTGGCCC AACTGCAGCG TCGCACGGGT CTTGATGCAT TGATCGCCTG CCCTGCCAAC ACCCTCCCTG CGCAAAAGCC GGAAGCTGAG GGCATGGTGA TTCCGATTGA ACCCACACCC CTGAAAACTG CTTGCCAGAT GGGTGCCGTC GCAGGTCAGA CTGAAGCCAA TCCCCCAGCC TGTGCAGCCC CTGTGGTGAC GTCGGTGCTC AGTTCAGAAC AACTGAGCGC CATTCATCAG TTGCTGGATC GCATTGCAGA GCGTCAGCGC TCGGATTTCG GCAACATCGT TTCTGATGTC AAACCAGACG GCACATTGAT CACGGCCTGT GATCGCTGGA GTGATGCAGA GCTGGTCAAG GGACTGGCCT CGATTGCACC CGGTGAGGGC GTTCTCAGTG AAGAGGGGTC CCAGCGTGTT CCCCAGAGCC GGGCTTACTG GGTTGTGGAC CCCCTGGATG GCACCACGAA CTTCGCGACG GGTATTCCGG TGTGGGCCAT CTCCGTGGCG CGTTTTGTTG ATGGCCGCCC CAGTGAGGTG TTCCTTGATG TTCCTGCCCT GGGTCAGCGC TTCGTGGCGT TGCGGGGGCG TGGTGTCATG CGCAATGAAC AAGCGTTGAC CACAGCGACT CGCCAGCACG TCAACAGCGC ATGCGTGTCG TTGTGCAGTC GTTCGATCCG TGTGTTGCAG CGAAAACCAA ATCAGCCTTT TCCTGGAAAG ATCCGACTGT TCGGCGTGGC CAGCCTCAAT CTGGTGAGCG TGGCGATGGG CCAGACCATT GCTGCCCTTG AGGCCACCCC CAAGATCTGG GATCTGGCGG CTGCCTGGCT GGTTCTCGAT GAATTGGGCT GTCCGATCCG CTGGTTGGAC ATCGATCCCG CTGATCTGTC GCCGGGTCAG TACTTGTCTC AGACCAGTTT TCCAATGCTT GCTGCGGGCT CATGGTCTGA GCTGGCGCGC TTTCTGCCCT GGGGTGAAGC CCTGCTCCAG CCTTAGTGGT TGCGCGTTGA GTGCGAGGAG TGTTATAGTT TTGTCTTGCG CAGGAGCCGA GAGGCTTGAG CGCAAGACCG AAGCCTGAGG GGCGAAAGCC TTGAGGTGTC TTGGGTCACT TACAAGATCA AGAGGGAGCG ATCCCACGGT GTTGTAAGTT CTTCAAGCGG TCGCGAGAGG CCGCGTTGAT CAGTTACCAC TCTTCTGAAA GGAAGGGGCT AGGGGATTGA TCGCACCTGG ACAATTGAAA AGTTTAGGAA CTGACGCTTT CATCGCGTTT GGTTCTGAAC CGAGCCGAAA GGTGAGGTGA GGGACTGAAT GAAGAAGCGA TGAAGGTGTG AGGTCCCGTC AAAAAATTTC GTTGCGTCGA AGCATTGTGC TTGCAACGGG AAGGTTTTCA CGATCCTTTC TGTTGCCGGT GTGCGCAATG TGGAGCAACA ACCGGATCTG AGATCCTGGA AAGTCATAGA TAGAGAAATC TAGATGTGCA CTCTTAAGAA CCCTTTCTGT GTCAGCGGGA AGGAGGCCTC AACTGTTGCC AGTTTTTACT GAGTAATGGG TGACGCAAAT CAAGTTGAGA TGATGAAGAT TATCAAGAGG ACTTGATCTA CGCCGGAGAG TTTGATCCTG GCTCAGGATG AACGCTGGCG GCGTGCTTAA CACATGCAAG TCGAACGAAC CTTCGGGTTA GTGGCGGACG GGTGAGTAAC GCGTGAGAAT CTGCCCTCAG GAGGGGGATA ACGGCTGGAA ACGGCCGCTA ATACCCCATA TGCCGCGAGG TGAAATGAAT TTCGCCTGAG GATGAGCTCG CGTCTGATTA GCTAGTTGGT GGGGTAAAGG CCTACCAAGG CATCGATCAG TAGCTGGTCT GAGAGGATGA TCAGCCACAC TGGGACTGAG ACACGGCCCA GACTCCTACG GGAGGCAGCA GTGGGGAATT TTCCGCAATG GGCGAAAGCC TGACGGAGCA ACGCCGCGTG AGGGATGAAG GCCTCTGGGC TGTAAACCTC TTTTATCAAG GAAGAAGATC TGACGGTACT TGATGAATAA GCCACGGCTA ATTCCGTGCC AGCAGCCGCG GTAATACGGG AGTGGCAAGC GTTATCCGGA ATTATTGGGC GTAAAGCGTC CGCAGGCGGC CCTTCAAGTC TGCTGTTAAA ACGTGGAGCT TAACTCCATC ATGGCAGTGG AAACTGTTGG GCTTGAGTGT GGTAGGGGCA GAGGGAATTC CCGGTGTAGC GGTGAAATGC GTAGATATCG GGAAGAACAC CAGTGGCGAA GGCGCTCTGC TGGGCCATAA CTGACGCTCA TGGACGAAAG CCAGGGGAGC GAAAGGGATT AGATACCCCT GTAGTCCTGG CCGTAAACGA TGAACACTAG GTGTCGGGGG AATCGACCCC CTCGGTGTCG TAGCCAACGC GTTAAGTGTT CCGCCTGGGG AGTACGCACG CAAGTGTGAA ACTCAAAGGA ATTGACGGGG GCCCGCACAA GCGGTGGAGT ATGTGGTTTA ATTCGATGCA ACGCGAAGAA CCTTACCAGG GTTTGACATC CTGCGAACCT CTTGGAAACG AGAGGGTGCC TTCGGGAACG CAGTGACAGG TGGTGCATGG CTGTCGTCAG CTCGTGTCGT GAGATGTTGG GTTAAGTCCC GCAACGAGCG CAACCCACGT CTTTAGTTGC CAGCATTTAG TTGGGCACTC TAGAGAGACC GCCGGTGATA AACCGGAGGA AGGTGTGGAT GACGTCAAGT CATCATGCCC CTTACATCCT GGGCTACACA CGTACTACAA TGCTACGGAC AAAGGGCAGC AAGTTCGCGA GGACAAGCAA ATCCCATAAA CCGTGGCTCA GTTCAGATCG TAGGCTGCAA CTCGCCTACG TGAAGGAGGA ATCGCTAGTA ATCGCAGGTC AGCATACTGC GGTGAATACG TTCCCGGGCC TTGTACACAC CGCCCGTCAC ACCATGGAAG TTGGCCACGC CCGAAGCCGT TACTCCAACC CTTGTGGAGG AGGACGTCGA AGGTGGGGCT GATGACTGGG GTGAAGTCGT AACAAGGTAT CCGTACCGGA AGGTGCGGAT GGATCACCTC CTAACAGGGA GACAAACAAC GATTTTGATG CCTGAGTACT TTTATTCTTA GGCCGAAATC CTGTCACCTT ---AGGTCGA TCGGTACCTC AGCGTTGAAG TAACTGGATC AGCAGCAATG TTGATTTGAG TTATGGAGAT GA---TCAGT TCCTAAACTT TGTCTAGGTC ACACCCCA-- ---CAAGG-- --------GT TGAGT----- --TTTTT--- T--------- ---------- ---------- -----C---- -C---TGGGC CATTAGCTCA GGTGGTTAGA GCGCACCCCT GATAAGGGTG AGGTCCCTGG TTCAAGTCCA GGATGGCCCA TTCGGTGTTG GGGGTTTAGC TCAGTTGGTA GAGCGCCTGC TTTGCAAGCA GGATGTCAGG AGTTCGAGTC TCCTAACCTC CACTGACCGA ACTCAATCTC CATTTTCCGT GTAACGGGAA ATGACTCGAA ATGAGGAG-- ---TGTGATT TGGATGATGT CCGCTG---- --GATGACCC CAGCTTCCTG TCATTCCAAG GATGAGTGAG AACTCATGAT TTGGTTGATA AGAT--GCTG GGCTCAATTC AAGTTATTGA GCAATCAATG ATTTGATTTG GAGTCTGGCA GAACCTTGAC AACTGCATAG GTGAAGTCTG GAA------- ---------A ---------- ------AA-- ---------- A--------- --------C- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >venter_19 726 bp rna ---------A AAGGGCAGCA AACUCGCGAG AGCUAGCAAA UCCCAUAAAC CGUGGCUCAG UUCAGAUCGU AGGCUGCAAC UCGCCUACGU GAAGUAGGAA UCGCUAGUAA UC-GCAGGUC AGCAUACUGC GGUGAAUACG UUCCCGGGCC UUGUACACAC CGCCCGUCAC ACCAUGGAAG UUGGCCACGC CCGAAGUCGU UACUUUAACC CUUGUGG-AG AAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA AAUC-GAUUG UGAUG-UCUA AG-------- -U-AAUUUAU U--------- -------CUU AGGCCGCAAU CCUGUCACCU UAA-GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUU-U GAA-UUGAU- ---U------ ---------- ---UUAUA-- ---------- ---------- ---AAUU-AA UUCUUUGAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAACAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGGUU-- -UCU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------U UC--GUUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAAACUAUC CUGAAUAACU AAUUUC-UGG AG-AAAAU-- ---------- -UUGAAGAUG UGG-CUU-AG UACUGUCUAU UUGAAAA--- ----GAACCU AGCUUCUUAU CAUCU----- ---------- ---UCUGAAU ---------- ---------- -----AG-UU GAUAA..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >ATA05 906 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......GGGC TGATGACTGG GGTGAAGTCG TAACAAGGTA GCCGTACCGG AA-GGTG-CG GCTGGATCAC CTCCTAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -ACT-GAT-C GTGATGTCTG AG-------- -T-TATTTAT A--------- -------CTT AGGCCATGAT CCTGTCACCT TA--GGTCGA TCGGTACCTC --AAATTGAG CAT-CAAAGA AGGGTTGA-- ---------- ---GAGA--- ---------- -----TCAAC TTGGAGATTG GTAATCAATT TCAGTT-CCT AAACTT-GT- CTAGGTCACA TCCCGCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGCTC-- -TCT-CCT-- --------GG GCCATTAGCT CAGGTGGTTA -GAGCGCACC CCTGATAAGG GTGAGGTCCC TGGTTCAAGT CCAGGATGGC CCA------T TC--GGTGTT ---------- -------GGG GGTTTAGCTC A-GTTGGTAG AGCGCCTGCT TTGCAAGCAG GATGTCAGCG GTTCGAGTCC GCTAACCTCC A-------CT GACTGAGTAC CTG------- ---CTAACCA CTAAAAGGAG ATGAAACCCT TTTGTGA--T GTGATTT-AG AATTTTAAGT TTGCTGGAA- ----GACCCT AGCTTCCTAT CATTCC-AGG CCTAAA---- ------TACT GT-------- ----T-TTTA GGCGAGG-CT GACAGGACGC TGGGCTC--A CTGCAATTC- ---------- GCAA------ -------GAA TTACAGAGAT G-TACAGCA- GAACCTTGAC AACTGCATAG GT--GAGTCT G-GAAAGAAT -AAAG-CATC T--C-AT-GG ATG-CATTAT TTTCGGATAC CAACTAATGA GATCTGC--- -GTAA----- ----GCAGTG ATCTGAGGTT GATTATAAAG AGAATAATGT TTGA-TTCTT --GAGTCAAG AGCCGAGA-- CTCTATAACG TTCTTTAGAT -GTCATCGAG GCATCGAGAG TTTGATTGGT AATTCAAACC ATCTTTAATG ACAAGTAATC -AG------- -----GGTAA ---------C CTGAAAAATT TGAGATTGAG GCCAGGTGAA TTACTGAGAA TACGTATTCA ACTACGTCAA GCGTTATAGA GATTAATT-- -G........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >B1_3R 640 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......ACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -CUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUAUU-G AGAUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UUUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAA... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >F3_3R 633 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-UCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-CC-GGUA GUAAAGGAA- ---------- --AUGUUUUG AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUA.... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >E5_3R 644 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......AACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-UGUA GA-AAGGGAA ---------- --UUUUUU-G AGUCGUGACC AUAUU----- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GUCAA.... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .........G AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-AAUA GA-AGGGAAA ---------- --AUGUUU-G AGUUGUGAUC GAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUCAUUGA AUUA------ --UUCAUUG- AUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UUUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUUU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --AGAUUC-U UUA------- ---------- ---------- ---UUUGA-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGAU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAAUG-CAAA UA-AGGGAAU ---------- --U-GUUC-- UUGAGUGUAA UAAUUGUU-- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UU-U------ ---------- --------A- ---------- ---------- -------UCU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UAUAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUUU GC-------- ---------- -UAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UGAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUU..... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >D6_3R 648 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....CAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AUGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAUU-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUA-CAU AAAUU-UAAA GA-AGGGAAU ---------- --U-GUUAAU AUAGGUGAUU UAGUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UA-------- ---------- --------AA ---------- ---------- -------UAC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UU-UA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -UAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UGAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >E6_3R 642 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....CAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UGA------- ---------- ---------- ---UUAA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CU--UC-CAU AA-UU-UGUA GA-AAGGAAA ---------- --CGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA A--------- ---------- --------CC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU A-AAG-ACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUAAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU GA-UU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --UUUUUG-- AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA U--A------ ---------- --------AU ---------- ---------- -------UUU AUUAAGACGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGC. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >F6_3R 646 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........C CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAUU-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AAAUU-UAAA GA-AGGGAAU AG-------- --U-UAUG-- AGUAAUGAUU UAGUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UU-A------ ---------- --------AG ---------- ---------- -------UAC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAUU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -UAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UGAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUUU- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >A3_3R 769 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .........C CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-AAA -ACU-GAUU- GUGAUGUCUU AG-------- -U--UAAAUA UU-------- -------CUU AGGCCGCAAU CCUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --UGAUUA-- ---------A AAAAUAA--- ---------- ---AUAA--- ---------- -----UUU-- -UU------- ----UUAAUU UCAGUU-CCU AAACUU-GU- CUAGGUCACA CCCAUCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---U-GGU-- -UCU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCAACCAC CCAGAUAUCA AAUCA--AGG AG-AUUUGUU ---------- -GAUUUUGAU GUGACUUAGA AGUUGUUUUA CUGAGAG--- ----GAACCU AGCUUCCUAU CAUUAC-U-- ---------- --------CU UUCUA----- ---------- ----AAA-CU AAU----U-- ---------- -------U-- ---------- ---------- ---------- ------U--- ---------- ---------- -------U-- -A-GAAUUUU G-AUAAGACG -CUGG-GCUC U--C-UA-AG ACU-AAUUAA AAUGUCUUAG UUAAGU---- ---------- --UCA----- ---------- -----GUAGA ACCUUGACAA CUGCAUA--G GUGA-GUCUG --GAAAGA-A UAA-AGCA-- UCUCAUAGAU GUAUAUUUC- ---------- ---------- -----UUUAA UUUCAGAGAU UAUUUGAUAG UUUCUAUCAG GUUUUUCUUG AAUUAAUAGA AUUAAUGUUU GAUUUUGAAU AAGAAUCGAG ACCCUAUAAC UAUUAAGUU- ---------- ---------- -----AUAGA GGUUUAU--- -GGUCAA... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >H6_3R 646 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....CAACC CUUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU------AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUU-CAU AA-UC-UGUA GA-AAGGGAA ---------- -AUGUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-U------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------AU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU UUAAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUUAAU-G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAG.. .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >C5_3R_II 647 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-U-U CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UGGA GA-AAGGAA- ---------- --AUUUUUUG AGUUGUGAUC AA-UU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGAAA ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC UUUUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUGGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >D6_3R_II 646 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U CGA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUGAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UC--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-UU-UAUA GA-AGGGAA- ---------- --UUGUUUGG AGUUGUGAUC AAAU------ CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGAAA ---------- ---------- --------GC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >D10_3R_II 648 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UUU CUAGGUCACA CCCAUUU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUU-CAU AA-AC-UAUG AG-AAGGAAA ---------- --UUUUUU-G AGUAGUGAUC AAUUU----- CUGAAC---- ----GAAGCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UAAAA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 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---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- >A12_3R_II 647 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA AU-------- -------AUU AU-----UAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAU-A--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-UC-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC -A-UU--AUU CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGAAA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUA U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >A3_3R_II 645 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACUUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---CUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUA-CAU AA-UC-UGUA GA-AGGAAAA ---------- --ACUUUU-G AGUUGUGAUC AAAUU----- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUA- ---A------ ---------- -----UGAAA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAC--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95ED 646 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUGA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCACUU-CCU AAGCUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GCUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUU-CAU AA-UU-UCUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC AA--UU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC UUUUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUGGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------UG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95EE 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCACCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AGGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUG AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAACAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95F1 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGCGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CGC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUA GAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUAAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95F5 713 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AU--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGGGU GUU-UUUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUGGCU-GUU AAGCUU-CG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UC AU------UC UUG------- ---AUGAUG- -------GAA -----CUCUU GGCAUA---G GUUGACAUAG AC-----GGA UCUUGGU--- ----GAAUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA AUA------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGACUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--GAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUCC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUA AGUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GCUUUG GUGUGACUUG CUUGAUGUUU GUAUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA UCUAUUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAACAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AU--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUUC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GAG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAUGUA AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUA UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAACAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95FA 651 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUAAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-GU-UGGA GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUG-G AAUUGUGAUC AAAA-U---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------GA UCACC----- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCUA AA-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UAG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_95FB 651 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUAAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AA-GU-UGGA GA-AAGGAAA ---------- --UUUUUG-G AAUUGUGAUC AAAA-U---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------GA UCACC----- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU --AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCUA AA-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UAG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG G-UGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----CA UCUCUGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AA-CU-UAUA GA-AGGGAAA ---------- --CGUUUU-G AGUUGUGAUC AAA-UU---- CUGAAA---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA A--------- ---------- --------UG AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--U-UUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GUAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCU-GG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGCA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCACCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCCCCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AU------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAGG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUG AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUA UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAACAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUAGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCCGC-CAU AA-UC-UUGA GA-AAGGAAA ---------- --CUUAUU-G AGAUGUGAUC AAAA-U---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UA-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UU AUUAAGGUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCGUAG AU--UUUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUU U-UUAAU--A AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9607 713 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--AGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUCC----- ---------- -A-------- -GGCA----- ---------- ---UGAAGUG AUUUGC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GUUUAACA GCGUGAUUUG CUUGAUGUUU GGUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAG-AAAGC CGAGUCCUGA UUAAUUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAAAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_960C 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGGUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUA GAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9612 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUA GAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUAAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9615 647 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUU-U UAU------- ---------- ---------- ---UUAG--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCG-C CUCUUC-CAU AA-CA-GGUA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGUUGUGAUC GUUAUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAGAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G UUG-CAGAUU UAUUAUUUAU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCACCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GGACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUA GAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCAGUAUCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCGGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCCGC-CAU AA-UC-UUGA GA-AAGGAAA ---------- --CUUAUU-G AGAUGUGAUC AAAA-U---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UA-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCGUAG AU--UUUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUU U-UUAAU--A AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_961C 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAGCCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-UU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACC----- ---------- ---UGAAGUG AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGCCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_961D 713 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AU--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AUUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- CGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AU------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACAU-AG AC-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGU UUU------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU UAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUCC----- ---------- -A-------- -GGCA----- ---------- ---UGAAGUA AUUCGC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GUUUAACA GCGUGAUUUG CUUGAUGUUU GGUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAG-AAAGC CGAGUCCUGA UUAAUUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAAAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_961E 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AG------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-UU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACC----- ---------- ---UGAAGUG AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCAUGAUUUG CUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... ... >3_9622 645 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUACCUC --ACAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---CUUAU-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UUAUUU-CCU AAGUUUUCU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UC UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AU--G-UACA GA-AAGGAAA ---------- --UGUUUU-G CGUUGUGAUC AAA-UU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA C--------- ---------- --------UU AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAA----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... ... >3_9625 661 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUUAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---CUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUU-CGU AU-CU-UAAG AA--UGGAAA U--------- --UGUUUU-G AGUUGUGCCC UAUUUU-ACU CUGAGU---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUUU----- ---------- ------CGAU GUAAU----- ---------- --------UA AAUUAGAAGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAUUA---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAAU-G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -AUAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_962F 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUGCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCACCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGCCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AU------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGA UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUG AAUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUA UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAACAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9632 713 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AU--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AUUCAC UCAUCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- CGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AU------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACAU-AG AC-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGU UUU------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUCC----- ---------- -A-------- -GGCA----- ---------- ---UGAAGUA AUUCGC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GUUUAACA GCGUGAUUUG CUUGAUGUUU GGUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAG-AAAGC CGAGUCCUGA UUAAUUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAAGAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9633 648 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGC -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UUA ---------- -------AUA UU---AUUAU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UGA------- ---------- ---------- ---UUUA--- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAUUU-CCU AAGUUU-UU- CUAGGUCACA CCCAUUAU-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUUACCA-C CUCUUC-CAU AU-UC-UGUA GA-AAGGGAA ---------- --AUUUUG-U GUUGUGAUCG UA-AUU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UG-A------ ---------- --------AA ---------- ---------- --------CC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAU----- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC A-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9636 712 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UCUGGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UGAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGAAC-CAA -CCU-CAA-A UGAUGAUCAC CA-------- -C-UUUUUAG U--------- -------GAU CCAUUUGACU GUUCAUUCCU AA--GGUCGA UCGGUACCUC --A-GUGAGU GAU-AAUCAC UCACCUCG-- ---------- ---GUCC--- ---------- -----UUAAG CUUGUCUAGG UCACCACCCC UUAGCU-GAU AAGCUU-UG- UGGGAUGGG- C--CCGAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGG---- --UU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA------- UC--GGGAUU ---------- -------GGG GGUUUAGCUC A-GCUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUAACCUCC A-------UU AU------UC UUG------- ---AUAAUG- -------GAA ------CUGU GGCACAG--G GUGACUU-AG AA-----GGA UGUUGGU--- ----GAUUCC AGCCUCGUUU GAUUCU-UGU UUC------- ---------- ---------- ---------A A-----G-CU CAAACGAUGC UGGGCUC--A --GCAAU--- ---------- ---------- -------GGG U--UCAGCA- --------A- GAACCUUGAA AACUGCAUAG GU--AAGUCU G-GA---AAU -AAAG-CAUC U---CAC-AG A------GAU GAUUC----- ---------- -A-------- -GACA----- ---------- ---UGAAGUG AGUCAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GUUACG GCGUGAUUUG UUUGAUGUUU GUUUCAA--- ---------- -CAAU----- ---------- -----UCUG- ---------- -GAGAAAAGC CGAGUCCUGA AUCAAUUGAU ---------- ---------- ---------- -------CAG GAAUAAAAU- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_9639 648 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- -------UAA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --ACGUUC-U UAA------- ---------- ---------- ---UUAAU-- ---------- ---------- ---------- -UUAAGGAUU UCAUUU-CCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUUAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CU-- -UU--CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA CCUCUGUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAUCACCA-C CUCUUC-CAU AAUUU-GAUA GA-AGGGAAA ---------- --UGUUUU-G AGAUGUGAUC AAA-UU---- CUGAAC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAA UC-A------ ---------- --------AA C--------- ---------- --------UC AUUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUAAA----- ---------- --CUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-AAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGACU UUUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAA-UAA- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UU--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ... >3_963D 654 bp rna .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .UUGUGG-AG GAGGACGCCG AAGGUGGGGC UAAUGACUGG GGUGAAGUCG UAACAAGGUA GCCGUACCGG AA-GGUG-CG GCUGGAUCAC CUCCUAA--- -----CAGGG -AGACA-ACA -A-------- --AAUGU--- ---------- --------AA ---------- -------AUA UU---A--AU UUUGUCACCU UA--GGUCGA UCGGUAUCUC --AGAUUC-U UAU------- ---------- ---------- ---UUU---- ---------- ---------- ---------- -UUAAGAAUU UCAGUU-UCU AAGUUUUUU- CUAGGUCACA CCCAUCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------UU-- -UUU-CCU-- --------GG GCCAUUAGCU CAGGUGGUUA -GAGCGCACC CCUGAUAAGG GUGAGGUCCC UGGUUCAAGU CCAGGAUGGC CCA-----UA UCUCUAUGUU ---------- -------GGG GGUAUAGCUC A-GUUGGUAG AGCGCCUGCU UUGCAAGCAG GAUGUCAGCG GUUCGAGUCC GCUUACCUCC A-------CU GAAUACCA-C CUCUUA-CAU A--UU-UAAA GA--GGGAAA U--------- --UGUUUU-G AGUCGUGUCC UAAUUU-GCU CUGAGC---- ----GAAUCU AGCUUCCUAU UUUA------ ---------- -----UUCAA ---------- ---------- --------UA AAUAAGAUGC UGGACUC--A UUGAA----- ---------- UUUUUU---- ---------- --UUCAUUG- UUUUCAG-A- GAACCUUGAC AACUGCAUAG AU--UAUUUU U-GAAGACAA -UAAG-CAUC U-UUAAU--G AUG-CAGAUU UAUUAUUUGU GC-------- ---------- -GAAU----- ---------- --------GC AUUAAAUAG- CAAUUCU-AU UAAGCU---- ---------- ---------- GAUGCUUCAA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----UUA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------UUG AAGUUAUU-- -GGUCAAGCU ACAA...... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 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